Фамилия Янтуховский — редкий пример фамилии на -ский, образованной от тюркского имени. Её основа — личное имя Янтух, которое состоит из двух частей: «ян» (душа) и «тух» (родиться, происходить). В тюркской ономастике такие двухосновные имена были распространены у башкир, татар и казахов. Янтух — вариант имени Янтуган или Янтуря, которое давали мальчикам с пожеланием долгой и счастливой жизни. Суффикс -овский типичен для польско-украинской модели образования фамилий, что указывает на возможную миграцию носителя имени в западнорусские земли.

Скорее всего, фамилия сформировалась в среде православного или окатоличенного дворянства XVI–XVII веков. В Речи Посполитой шляхта часто переделывала восточные имена на польский лад, добавляя суффикс -ский, который давал статус. Янтуховский мог быть потомком татарского мурзы или башкирского старшины, принявшего христианство и получившего земельный надел на территории современной Украины или Беларуси. На это указывает и окончание -ский, которое редко встречается у чисто татарских фамилий — там типичны -ов, -ев, -ин.

Географически фамилия почти не встречается в Поволжье или на Урале, где имя Янтух было бы ожидаемо. Напротив, большинство Янтуховских живёт в западных областях России и на востоке Украины. Это подтверждает версию о том, что предок Янтуховского покинул тюркскую среду и интегрировался в славянскую. В метрических книгах XIX века фамилия фиксируется в Харьковской и Курской губерниях.

У фамилии есть однокоренные «родственники»: Янтуганов, Янтурин, Янтушев. Но Янтуховский стоит особняком из-за суффикса -ский, который в русской традиции чаще обозначал владельческий или территориальный признак. То есть исходно Янтуховские — не просто «потомки Янтуха», а «люди с поместья Янтуха». Это делает фамилию не только этническим маркером, но и свидетельством социального статуса предка.