Фамилия Янтюрин — редкий пример, когда за привычным русским окончанием -ин скрывается основа явно не славянского происхождения. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского корня, и её появление связано с историей служилых татар, башкир или других тюркоязычных народов, которые входили в состав Русского государства начиная с XVI века.

Разбор фамилии стоит начать с суффикса -ин. В русских фамилиях этот суффикс присоединяется к основам, оканчивающимся на -а, -я, а также к словам, обозначающим лиц мужского пола (Иван → Иванов, но Кузьма → Кузьмин). В случае Янтюрин основа «Янтюр» или «Янтюря» — это, скорее всего, личное имя или прозвище. Само имя Янтюр (Янтур) — сложное, в нём соединились два тюркских корня: «ян» (душа) и «тур» (стой, живи, будь). Буквально — «будь душой» или «живая душа», что могло быть пожелательным именем для ребёнка. В башкирском языке существует имя Янтур, а в казахском — Жантөре, что означает «господин души».

Вероятнее всего, фамилия Янтюрин образована от имени Янтюря, которое в разговорной речи дало форму Янтюрин — «чей?» — сын Янтюри. Географически фамилия тяготеет к Урало-Поволжью: наибольшее число носителей встречается в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане. Это подтверждает гипотезу о происхождении из среды тюркского населения, которое активно контактировало с русскими, принимало православие и получало фамилии по русской модели.

Встречается и вариант написания «Янтурин», что связано с особенностями передачи тюркских звуков в русской записи. В некоторых документах XIX века фамилию могли записывать через «у» (Янтурин), а в более поздних — через «ю» (Янтюрин). Оба варианта означают одно и то же. Сословно носители фамилии относились к государственным крестьянам или к военно-служилому сословию (например, к оренбургским казакам или тептярам), что типично для региона.

Спорных версий немного. Можно было бы предположить, что в основе лежит топоним (название реки или села), но известных географических объектов с корнем «Янтюр» не зафиксировано. Поэтому версия о происхождении от личного имени остаётся основной и наиболее обоснованной.