Фамилия Янусильев — наглядный пример того, как редкая форма суффикса может поставить в тупик при попытке определить её происхождение. На первый взгляд, она похожа на типичную русскую фамилию с патронимическим суффиксом -ев, но её основа, Янусиль, не встречается в календаре православных или католических имён в таком виде. Это заставляет искать объяснение в сложении двух компонентов.

Скорее всего, в основе лежит двусоставное имя, распространённое у народов, испытавших влияние как славянской, так и тюркской или иранской традиции. Первая часть — Янус — может восходить к имени Ян (русская форма от Иоанн) или к имени Януш (польско-литовская форма того же имени). Вторая часть — иль — скорее всего, является искажением тюркского «улы» или «иль», что означает «сын» или «родина». Таким образом, исходное имя Янусиль могло означать «Янус-сын» или «сын Януса», что характерно для народов Поволжья, Кавказа или Средней Азии, где подобные сложные имена (например, Абдусиль, Алисиль) встречаются до сих пор.

Другая, менее вероятная гипотеза связывает фамилию с местным прозвищем. В некоторых говорах «янус» могло быть искажением слова «янус» (двуликий) или простонародным именованием человека с двойственным характером. Однако суффикс -иль в таком случае необъясним. Также не стоит путать с польской фамилией Янушевский или украинской Янусик — суффикс -ев указывает на русскую адаптацию, а не на польскую шляхетскую традицию.

Носители фамилии Янусильев встречаются крайне редко, в основном на юге России и в Западной Сибири. Это говорит о том, что фамилия могла появиться в среде переселенцев или крещёных инородцев, чьи имена были русифицированы при записи в метрические книги. Сословная принадлежность, скорее всего, была крестьянской или мещанской — дворянские роды с таким окончанием не фиксируются.