Фамилия Яратханов — редкий пример, где на стыке оказались два разных языковых мира: тюркский корень и русский фамильный суффикс. Носители такой фамилии почти наверняка имеют предков из тюркоязычной среды, скорее всего, татарской, башкирской или казахской, но сама фамилия оформилась уже под влиянием русской административной традиции — через добавление суффикса -ов.

Основа «Яратхан» состоит из двух частей. Первая, «Ярат», восходит к тюркскому корню «яр» («обрыв», «берег», «круча») или к глаголу «ярату» («творить», «создавать», «любить»). Вторая, «хан», — распространённый в тюркских языках титул правителя или почётное добавление к имени, означающее «владыка», «господин». Вместе «Яратхан» может означать либо «хан, живущий у обрыва», либо «хан-творец», либо «хан, которого любят». Впрочем, в бытовой ономастике это чаще было личное имя или прозвище, а не указание на реальный титул.

Суффикс -ов стандартно указывает на принадлежность: «чей?» — Яратханов, то есть потомок или сын человека по имени Яратхан. Такая модель образования фамилий характерна для русской традиции, и она накладывалась на тюркские имена в XVI–XIX веках, когда крещёные татары и башкиры получали фамилии по отцу. Фамилия могла закрепиться и у мусульманского населения, если семья попадала в сферу русского делопроизводства.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически смешивались тюркское и русское население: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область, а также северный Казахстан. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении — возможно, от одного родоначальника из конкретного села или аула.

С точки зрения словообразования, интересно, что в фамилии сохранился «хан» без редукции — в русском языке титул часто превращался в «канов» или «ханов», но здесь он стоит в полной форме «Хан». Это указывает на то, что имя было осознанным и не подверглось бытовому упрощению. Сравните с фамилиями Яруллин, Ярханов — у них та же основа «яр», но иной суффикс или окончание.

Таким образом, Яратханов — фамилия, которая рассказывает о предке, носившем тюркское имя с почётным компонентом, и о том, как это имя попало в русскую фамильную систему. Сегодня её носители — скорее всего, потомки тех, кто жил на границе степей и лесов, где встречались языки и культуры.