Фамилия Юдеевы — редкий случай, когда в основе лежит не имя, а этноним, причём с неочевидной историей. Вопреки первому впечатлению, корень здесь не от «иудей» в современном звучании. В русских говорах и документах XVI–XVII веков слово «юдей» или «юдея» могло обозначать еврея, но с устойчивым «ю» в начале — такая форма встречается в старообрядческой и южнорусской среде. Однако есть и вторая, более бытовая версия: «Юдей» как вариант просторечного имени Иуда, которое на Руси давали не в честь предателя, а в память об апостоле Иуде Фаддее. В крестьянской среде имя не считалось «проклятым» — его носили, например, в северных и сибирских областях.

Суффикс -ев указывает на типичную патронимическую модель: Юдеев — сын Юдея. Форма множественного числа Юдеевы закрепилась как фамилия целого рода. Встречается она крайне редко, в основном в Поволжье и на Урале, где в XVIII–XIX веках оседали староверы и переселенцы из центральных губерний. В метрических книгах Пермской и Вятской губерний попадаются крестьяне с этой фамилией — вероятно, предки были не горожанами, а сельскими жителями, возможно, занимались земледелием или ремеслом.

Интересно, что фамилия Юдеев почти не встречается за пределами России, а её написание устойчиво — без вариантов вроде «Юдиев» или «Иудеев». Это говорит о том, что она сложилась в среде, где письменная фиксация была редкой, но форма закрепилась однажды и не менялась. Если сравнивать с однокоренными — Иудин, Юдин, — то Юдеевы стоят особняком: у них нет такой же частотности, и этимология не лежит на поверхности. Для носителя фамилии это означает, что предки почти наверняка были из среды, где имя или прозвище «Юдей» бытовало как обычное, без религиозного подтекста.