Фамилия Юханадзе — яркий пример грузинской модели образования фамилий, и её разбор стоит начать именно с суффикса. Компонент -дзе в переводе с грузинского означает «сын» и является одним из самых распространённых фамильных суффиксов в Западной Грузии (регионы Имеретия, Гурия, Аджария). Таким образом, Юханадзе буквально значит «сын Юхана».

Основа фамилии — личное имя Юхан. Это грузинская форма библейского имени Иоанн (в русской традиции — Иван), которое восходит к древнееврейскому Йоханан — «Яхве (Бог) смилостивился», «Бог даровал». В грузинском языке имя Иоанн звучит как Иоанэ, но в народной, разговорной среде закрепились сокращённые варианты: Вано, Иванэ, и в том числе Юхан. Встречается также форма Юха, от которой образована фамилия Юхашвили (с суффиксом -швили, также означающим «сын»), но Юханадзе — более редкий вариант.

С точки зрения социальной истории, суффикс -дзе не указывает на знатное происхождение (в отличие от суффикса -ели или -ишвили у княжеских родов). Носители фамилии Юханадзе, скорее всего, принадлежали к свободным крестьянам, ремесленникам или мелким торговцам. Географически фамилия тяготеет к западным регионам Грузии, особенно к Аджарии и Гурии, где такие формы на -дзе особенно частотны. Встречаются также варианты написания с одной «н» — Юхадзе, но форма Юханадзе более полная и архаичная, сохранившая имя-основу целиком.

В русском языке фамилия не склоняется, если принадлежит мужчине, и склоняется, если женщине (Юханадзе, Юханадзе, Юханадзе и т.д.), но в бытовой речи часто остаётся неизменной. Учитывая, что фамилия редкая и имеет чёткую национальную привязку, её носители почти наверняка имеют грузинские корни, а само имя Юхан в качестве фамильной основы встречается реже, чем более распространённые Георгадзе или Давитадзе, что делает Юханадзе любопытным ономастическим маркером Западной Грузии.