Фамилия Юхтарова — женская форма от Юхтаров, и её разумнее начинать с мужского варианта. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Юхтар. Слово «юхта» в русских говорах имеет два основных значения: особый способ выделки кожи (юфть, или юхта, — мягкая дублёная кожа, которую использовали для обуви и сёдел) и, реже, болезненное состояние, ломоту в теле. Первое значение куда более вероятно для прозвища.

Скорее всего, Юхтарем называли кожевника, мастера по выделке юфти. Это было распространённое ремесло в северных и центральных губерниях России, особенно в Ярославской, Костромской и Вологодской областях, где существовали целые слободы юхотников. Фамилия образована по продуктивной модели: основа «юхтар-» плюс типичный русский суффикс принадлежности «-ов», то есть «сын Юхтаря». Женская форма Юхтарова — это исторически «жена или дочь Юхтарова».

В ономастике фамилия Юхтаров относится к группе «профессиональных» прозвищных фамилий, аналогично Скорнякову, Сыромятникову или Кожевникову. Интересно, что в отличие от фамилии Юхтов (от той же «юхты»), форма с суффиксом «-арь» (Юхтарь) прямо указывает на деятеля, а не на предмет. Поэтому версия о происхождении от личного имени Юхта (гипотетической производной от Юрий или Юхим) менее убедительна — для имени характернее суффикс «-ов» без промежуточного «-арь».

Фамилия редкая, встречается в основном в Поволжье и на Урале, куда переселялись ремесленники из центральных областей. Встречаются варианты написания с одной «т» (Юхаров) — это результат диалектного произношения, где «хт» упрощалось до «х». Носительница фамилии Юхтарова может с уверенностью считать своих предков мастерами кожевенного дела, людьми, чей труд был востребован и в крестьянском быту, и в армии.