Фамилия Юхтанова — женская форма от Юхтанов, и её происхождение стоит искать в прозвище, а не в крестильном имени. Основа — «юхта» или «юхть», слово, которое в русских говорах имело два основных значения. Первое — особый сорт мягкой, хорошо выделанной кожи (юфть). Второе — диалектное название рыбы, чаще всего мелкой или вяленой, а также самой снасти для её лова. Таким образом, прозвище Юхтан мог получить кожевник, торговец кожей или, наоборот, рыбак, промышлявший на севере или в Сибири, где слово «юхта» в рыбном значении было в ходу.

Суффикс -ан- в основе указывает на то, что прозвище было образовано напрямую от нарицательного слова, а не от имени. Такая модель типична для северорусских и сибирских фамилий, где прозвища часто давались по роду занятий или характерному признаку. Окончание -ов превратило прозвище в фамилию, а -а — в женскую форму. Мужской вариант Юхтанов, скорее всего, сложился в XV–XVII веках, когда фамилии на -ов становились доминирующими.

Географически фамилия тяготеет к северным и восточным регионам России. Встречается в Архангельской, Вологодской областях, а также в Сибири — в Томской и Иркутской губерниях. Это косвенно подтверждает связь с рыбным промыслом: именно на Севере и в Сибири «юхта» как название рыбы была распространена. В центральных и южных областях она редка, что говорит о локальном характере прозвища.

Иногда фамилию пытаются связать с тюркским корнем, где «юхта» означало «близкий», «родной», но это маловероятно: для русской фамилии такая основа нехарактерна, и документальных подтверждений тюркского влияния на эту конкретную фамилию нет. Гораздо проще и логичнее объяснить её из русского диалектного словаря.

Есть и редкая возможность, что в основе лежит прозвище от глагола «юхтаться» — в некоторых говорах это означало «суетиться», «мешкать». Но такой вариант менее убедителен, так как глагольные прозвища обычно давались по действию, а не по отвлечённому понятию. Основная версия — кожевенная или рыболовная — остаётся главной.