Фамилия Юняшин — редкий случай, когда суффикс -ин указывает не на принадлежность отцу, а на прозвище по внешности или характеру. В русской ономастике суффикс -ин обычно присоединяется к основам на -а/-я (Иван → Иванов, но Гаврила → Гаврилин). Здесь же основа «Юняш» — это не полное имя, а уменьшительно-ласкательная форма от слов «юный», «юнец». В говорах «юняш» могли называть молодого, неопытного парня, подростка, а иногда — иронично — взрослого мужчину, который ведёт себя по-мальчишески. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, получил прозвище Юняш за молодость или юркость, а его потомки стали Юняшиными.

В отличие от фамилий на -ов, которые часто образовывались от полных крестильных имён (Пётр → Петров), Юняшин стоит ближе к прозвищному типу, как Малышов или Голованов. Интересно, что суффикс -аш в русских прозвищах нередко придавал слову оттенок просторечия или даже пренебрежения (ср. «дураш», «глупаш»). В случае с «юняш» такого оттенка нет — скорее, ласкательность или констатация возраста.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Вологодской, Костромской, Кировской областям, где такие прозвищные модели были особенно живучи. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении: возможно, прозвище закрепилось в одной деревне или волости. Вариант Юняшев (с суффиксом -ев) тоже существует, но Юняшин — более архаичная форма, сохранившая старую словообразовательную модель.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Юнкин, Юнцов — показывает, что все они образованы от одного корня «юн-», но разными суффиксами. Юняшин выделяется тем, что его основа не застыла в именительном падеже (как Юнцов), а сохранила живую разговорную форму прозвища. Это позволяет предположить, что предок носителя фамилии был известен в округе именно как «Юняш» — и прозвище приросло к роду намертво, без переоформления в стандартную патронимическую форму.