Фамилия Юзупанов — редкий случай, когда тюркское имя-основа прошло через несколько языковых фильтров, прежде чем стать русской фамилией. В её основе лежит имя Юзупан — вариант имени Юсуп, которое восходит к библейскому Иосифу (в арабской форме Юсуф). Переход «с» в «з» — характерное явление для некоторых тюркских диалектов, где звонкие согласные в начале слова встречаются чаще, чем в литературном арабском или персидском. Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который присоединили к основе Юзупан. Притяжательный суффикс -ов буквально означал «чей?» — то есть Юзупановы — это «люди Юзупана», потомки человека с таким именем.

Обращает на себя внимание, что в русском языке фамилия Юзупанов закрепилась с ударением на втором слоге (ЮзУпанов), хотя в тюркских языках имя Юзупан обычно произносится с ударением на последнем слоге. Это типичная русификация: при заимствовании ударение сместилось по аналогии с другими фамилиями на -анов.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Уралу, особенно к территориям, где исторически жили татары и башкиры. Встречается она и у казахов, но в форме Юзупанов чаще фиксируется именно у татар, прошедших через христианизацию в XVIII–XIX веках. В метрических книгах Оренбургской и Уфимской губерний можно найти записи о крещёных татарах с именем Юзупан, которые при получении фамилии не меняли имя на русское, а оставляли его в качестве основы.

Социальный контекст прост: носители фамилии — потомки крестьян или служилых татар, которые приняли православие, но сохранили в фамилии память о дохристианском имени. Никакого отношения к княжескому роду Юсуповых фамилия не имеет, хотя корень у них общий — имя Юсуф/Юсуп. Различие в суффиксах (-ов против -ев) и в написании согласной (з/с) указывает на разные диалектные и исторические пути: Юсуповы — аристократический род ногайского происхождения, Юзупановы — простонародная фамилия, возникшая независимо на восточных окраинах России.