Фамилия Загняева — женская форма от Загняев, и её разумнее начинать разбирать с мужского варианта. В центре внимания здесь не географическая привязка, а редкий и неочевидный корень, который сразу ставит перед исследователем задачу.

Основа «Загня-» в русских фамилиях встречается крайне редко. Наиболее логичное объяснение — происхождение от прозвища или мирского имени Загняй. Глагол «загнять» в диалектах означал «загонять, заставлять войти куда-либо», а в переносном смысле — «докучать, изводить» кого-то. Человек с таким прозвищем мог быть настойчивым, надоедливым или, наоборот, тем, кто загоняет скот в хлев, то есть пастухом или скотником. Суффикс -ай в русских прозвищах часто придавал слову оттенок действия или свойства (ср. Ломай, Бросай, Кричай), так что Загняй — это «тот, кто загоняет».

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с украинским или белорусским диалектным словом «загня» (западня, ловушка). В таком случае прозвище мог получить хитрый или осторожный человек, либо тот, кто ставил силки. Однако для фамилии, оканчивающейся на -ев, типичнее отыменное образование от глагольной формы.

Модель образования типична для русских фамилий: прозвище Загняй → отчество «Загняев сын» → фамилия Загняев. Суффикс -ев указывает на принадлежность к роду человека с таким прозвищем. Женская форма Загняева — это просто указание на жену или дочь Загняева.

Поскольку фамилия редкая, её носители, скорее всего, происходят из одной или нескольких соседних местностей, где прозвище закрепилось. В дореволюционных источниках и современных телефонных справочниках она встречается единично, что говорит о локальном бытовании, возможно, в центральных или южных губерниях России. Сословная принадлежность предков, скорее всего, крестьянская или однодворческая — фамилии на -ев из прозвищ характерны для непривилегированных слоёв.