Фамилия Заключаева — женская форма, её мужской вариант — Заключаев. С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: суффикс -ев указывает на принадлежность («чей?» — Заключаев), а основа восходит к прозвищу или имени Заключай. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от личного прозвища, которое, в свою очередь, могло возникнуть из глагола «заключать».

Главный вопрос — в значении прозвища. Самая прямая версия: Заключаем называли того, кто имел отношение к заключению — не обязательно тюремному. В старину «заключать» означало также «запирать», «замыкать», «ставить запор». Прозвище могли дать кузнецу или плотнику, который ставил замки, засовы, или же сторожу, запиравшему ворота. В таком случае фамилия относится к профессиональным прозвищам, как Кузнецов или Плотников, но с более узкой и редкой специализацией.

Вторая версия, менее вероятная, но ономастически допустимая: связь с церковным именем Закхей (от древнееврейского «чистый, праведный»). В народном произношении имя могло исказиться до формы «Заклюй» или «Заключа», а затем получить фамильный суффикс. Однако для такого перехода нет устойчивых диалектных подтверждений, и версия с прозвищем от глагола выглядит убедительнее.

География фамилии Заключаев довольно узкая. По данным современных архивов и телефонных справочников, основные очаги — Волгоградская область и Республика Калмыкия, единичные носители встречаются в Ростовской области и Ставрополье. Такая локализация указывает, что фамилия сформировалась на юге России, возможно, в среде казачества или крестьян-однодворцев, где профессиональные прозвища нередко становились фамилиями.

Интересно, что в фамилии сохранился редкий суффикс -аев, который встречается реже, чем привычные -ов или -ев. В данном случае он возник не от тюркских корней (как, например, в фамилиях Бекмурзаев, Каратаев), а от чисто русского глагольного окончания -ай. Это делает фамилию Заключаев характерным примером «живого» прозвища, которое не успело обкататься до стандартной формы.

Коротко: предки носителя фамилии, скорее всего, были людьми, чья работа была связана с запиранием, замыканием — кузнецами-замочниками, сторожами или строителями запоров. Фамилия редкая, южнорусская, и её значение угадывается почти буквально.