Фамилия Закондраев — редкая и с трудом поддающаяся однозначному толкованию. В ней отчетливо слышится основа «-кондра-», но приставка «за-» и суффикс «-ев» указывают на нестандартную модель образования. Скорее всего, перед нами не прозвище, а адаптированная форма от составного имени или прозвища, которое переосмыслили на русской почве.

Самая правдоподобная версия связывает фамилию с каноническим именем Кондратий (от латинского conditus — «устроенный», «основанный» или от condere — «прятать», «сохранять»). В обиходе это имя давало множество производных: Кондрат, Кондраша, Кондрашка. Форма «Закондраев» могла возникнуть от прозвища Закондрай, которое в свою очередь образовалось при помощи приставки «за-» (в значении «позади», «за пределами» или как усилительный элемент) и основы «Кондрай» (краткой формы от Кондратий). В таком случае прозвище могло означать «тот, кто за Кондраем» — например, младший сын в семье, живший за двором старшего брата Кондрата, или человек, который следовал за кем-то по имени Кондрай.

Альтернативная, но менее вероятная версия отталкивается от нецерковного имени Кондрай, которое могло быть связано с диалектным глаголом «кондрать» — «корпеть», «делать с трудом». Тогда приставка «за-» могла придавать значение «закондрать» — «заработаться», «замучиться», и прозвище Закондрай дали человеку медлительному или усердному до изнеможения. Однако в русской антропонимии приставка «за-» в прозвищах чаще указывает на пространственное или родственное отношение, чем на интенсивность действия.

Суффикс «-ев» типичен для русских фамилий, образованных от основ на мягкий согласный или «й». Фамилия могла закрепиться в южнорусских или украинских говорах, где приставка «за-» в фамилиях встречается чаще (ср. Заболотный, Запорожец). Сведений о широкой географии или известных носителях фамилии Закондраев в открытых источниках нет — это указывает на её локальное бытование, возможно, в среде крестьян или однодворцев центральных губерний России. В любом случае, основа фамилии прочно связана с именем Кондратий, а приставка «за-» добавляет оттенок вторичности или подчиненного положения предка.