Фамилия Зализецкий образована по типичной для восточнославянских фамилий модели с суффиксом -цк(ий). Этот суффикс в XVI–XVII веках чаще всего указывал на географическое происхождение: так называли выходцев из какого-либо места, названия которого оканчивались на -цы, -цк или -ск. Основа «Зализец-» заставляет искать топоним, от которого пошла фамилия.

Самое прямое объяснение — название населённого пункта Зализцы или Зализец. Такие топонимы встречаются на западе Украины и в Беларуси. Например, село Зализцы (исторически — Заложцы) в Тернопольской области. Если фамилия ведёт род из этих мест, то Зализецкий — это «тот, кто родом из Зализец/Зализцов». Суффикс -ец в основе мог быть первичным (житель конкретного места), а -цкий добавился при оформлении фамилии.

Вторая, менее очевидная версия — связь с корнем «лиз-» (лизать) и приставкой «за-». В таком случае прозвище Зализа мог получить человек с какой-то характерной привычкой или манерой поведения. Но суффикс -цкий для прозвищного происхождения нетипичен: такие фамилии обычно оканчиваются на -ов, -ев, -ин (Зализин, Зализов). Поэтому версия с географическим источником выглядит убедительнее.

Фамилия редкая, в массовых списках дворянских родов не фигурирует. Скорее всего, её носили крестьяне или мещане, переселившиеся из западных губерний Российской империи в центральные или южные области. В современной России носители встречаются рассеянно, без ярко выраженного ареала. По написанию фамилию не стоит путать с Зализняцкий (от «зализняк» — болотистое место) или Залисский (от «за лесом»).

Если искать однокоренные фамилии, то ближе всего Зализский и Зализцев — они тоже отталкиваются от топонимов с той же основой. В украинском языке есть фамилия Зализець, которая могла стать промежуточной формой для русифицированного варианта Зализецкий.