Фамилия Заложниковы (в мужском варианте — Заложников) образована от прозвища Заложник. В старину залогом называли землю, которую из-за её избытка не удобряли, а оставляли под залежь. Существовали «дикие залоги» — брошенные участки со следами былой пашни, и нови, то есть целины. Прозвище Заложник мог получить крестьянин, занимавшийся земледелием залежного типа: при больших площадях он оставлял часть земли непаханой.

По другой версии, прозвище связано с прилагательным «заложный» — «находящийся за логом», то есть за широким оврагом. В этом случае Заложник — это человек, живший за таким оврагом. До появления точных адресов подобные именования помогали быстро найти нужного человека, и прозвище закреплялось за ним как основное.

Основа фамилии — слово «залог», а суффикс «-ник» указывает на лицо по действию или признаку. Формант «-ов» — типичный русский патронимический суффикс, означающий «чей?»: Заложников буквально значит «сын Заложника». Фамилия входит в разряд «календарных» (образованных от прозвищ), характерных для крестьянской и посадской среды.

Однокоренные фамилии — Заложный, Заложин, Заложнов. Они встречаются в центральных и южных регионах России, где было распространено залежное земледелие. Точное время и место возникновения фамилии Заложниковы требуют генеалогических разысканий, но её корни уходят в быт русского крестьянства, где прозвища часто отражали хозяйственный уклад или особенности ландшафта.