Фамилия Запечников — редкий случай, когда прозвище не просто называют человека, а буквально описывает его привычное место. В основе лежит слово «запечник»: так в русских говорах называли человека, который любил лежать или спать на печи, за печью, то есть в самом тёплом и укромном месте в избе. Прозвище могли дать домоседу, ленивцу или, наоборот, тому, кто по старости или болезни постоянно грелся у печи.

Модель образования проста и типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность — «сын Запечника». Такая форма чаще встречалась в центральных и северных губерниях, где фамилии на -ов были основным типом. В южных и западных регионах скорее появилась бы фамилия Запечниченко или Запечнюк.

Интересно, что у этого корня есть и более конкретное, ремесленное значение. В некоторых диалектах «запечником» называли того, кто делал печи или клал запечье — деревянный настил за печью, где сушили лучину, хранили утварь или спали. Так что предок мог быть не просто любителем тепла, а печником, мастером по устройству этого самого запечья. Обе версии правдоподобны, но прозвищная — первична: фамилии от занятий обычно образуются через суффикс -ник (Печников, Горшечников), а не через «за-».

Встречается фамилия нечасто, в основном в центральной России и на Урале, куда переселенцы принесли северные говоры. В дореволюционных источниках Запечниковы фигурируют среди крестьян и мещан — дворянской ветви не зафиксировано. Словарь Б. Унбегауна не упоминает эту фамилию, что подтверждает её локальный характер.