Фамилия Запорощенко — украинская по происхождению, и её разумнее всего разбирать через прозвище Запорощий. Суффикс -енко здесь ключевой: в украинской ономастике он означает «маленький», «сын» или «потомок». То есть Запорощенко — буквально «сын Запорощего», «маленький Запорощий». Такая модель (основа прозвища + -енко) была самой массовой в Левобережной и Степной Украине в XVII–XVIII веках, особенно среди казацких родов и крестьян, которые получали фамилии при переписях.

Прозвище Запорощий исследователи обычно связывают с украинским глаголом «запорощати». В прямом значении этот глагол описывает сильный, хлёсткий дождь, который «бьёт» по земле или крыше. Соответственно, Запорощим могли назвать ребёнка, родившегося в ливень, или взрослого, чей нрав ассоциировался с напористой, шумной стихией. В переносном смысле тот же глагол означал «говорить очень быстро, тараторить, сыпать словами». Человек с быстрой, захлёстывающей речью тоже легко получал такое прозвище.

Обе версии правдоподобны, и выбирать между ними без конкретных записей о первом носителе трудно. Важно другое: прозвище образовано от глагола, а не от географического названия (как, например, Запорожец — от Запорожья). Фамилия Запорощенко не имеет отношения к запорожским казакам напрямую, хотя могла бытовать в тех же регионах. Словообразовательная модель чисто прозвищная, а не топонимическая.

Встречаемость фамилии сегодня невысокая, и она почти не выходит за пределы украинского ареала: чаще всего Запорощенко фиксируют в Черкасской, Полтавской и Днепропетровской областях. В России фамилия редка, и её носители — потомки переселенцев конца XIX — начала XX века. В документах встречаются варианты написания с одной «с» (Запорощено) или с ударением на второй слог, но нормативное украинское написание — именно с «-енко» и через «щ».