Фамилия Заратустра — случай редкий и, на первый взгляд, совершенно нетипичный для русской ономастики. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён, прозвищ или названий ремёсел, эта напрямую восходит к имени основателя древнеиранской религии — пророка Заратустры (Зороастра). В русской среде такая фамилия не могла возникнуть стихийно в крестьянской или мещанской среде, где о зороастризме не имели представления. Её появление — результат книжного, искусственного происхождения, скорее всего, в среде духовенства или разночинной интеллигенции XIX — начала XX века.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: фамилия представляет собой чистую основу без какого-либо фамильного суффикса (-ов, -ин, -ский). Это так называемые «окаменелые» фамилии, которые не склоняются по падежам и часто встречаются у выходцев из южнославянских земель или у представителей западноевропейских культур. В русском контексте такая бессуффиксная форма — признак позднего, часто «кабинетного» происхождения. Семинаристы, получавшие фамилии по библейским или античным персонажам, могли взять себе имя пророка, чтобы выделиться или в знак особой учёности. Вторая версия, менее вероятная, но возможная: фамилия могла быть заимствована через немецкое или французское посредство — например, потомки обрусевших немцев, увлекавшихся восточной философией.

Географически фамилия Заратустра не привязана к какому-либо региону России. Она встречается единичными случаями, чаще всего в городах, где были духовные семинарии или университеты. Поскольку носителей крайне мало, сословная принадлежность предков восстанавливается с трудом, но логика подсказывает: если фамилия не была взята сознательно в советское время (что тоже возможно), то предок был либо священником, получившим «красивое» семинарское прозвище, либо интеллигентом, сменившим фамилию по идейным соображениям. В любом случае, носитель фамилии Заратустра — обладатель уникального ономастического артефакта, который едва ли имеет массовые параллели в русском именослове.