Фамилия Зашмарин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти полностью вытеснило исходное слово из живого языка. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Зашмарин — сын Зашмары. Основа же, скорее всего, восходит к древнерусскому или диалектному глаголу «шмарить» — жечь, палить, шпарить кипятком. Приставка «за-» могла добавить значение чрезмерности или законченности действия: «зашмарить» — сильно обжечь, опалить, испортить жаром. Прозвище Зашмара давали человеку, который либо сам получил сильный ожог, либо работал с огнём — например, в кузнечном или гончарном деле, где обжиг был главной операцией.

Альтернативная версия связывает фамилию с тюркскими корнями, где «шмар» или «шмара» могло означать что-то связанное с грязью или смуглостью. Но для центральных русских областей, где фамилия встречается чаще всего — Владимирская, Нижегородская, Ивановская области — более правдоподобно славянское происхождение от глагола со значением «жечь». В этих краях издавна были развиты кузнечное ремесло, смолокурение и углежжение, и прозвище по занятию или внешнему признаку было естественным.

Сама фамилия — довольно редкая. В дореволюционных переписях носители Зашмарины встречаются в основном среди крестьян и мещан. Ударение в фамилии плавающее: в разных говорах могут произносить и Зашмáрин, и Зашмарúн, и Зашма́рин. В современных справочниках закрепился вариант с ударением на второй слог — Зашма́рин, но в семьях старшего поколения нередко хранят местное произношение.