Фамилия Заячникова — женская форма, её мужской вариант Заячников. В основе лежит прозвище Заячник, а вот что оно означало — вопрос не с одним ответом. Самое прямое объяснение: заячником называли гончую собаку, специально натасканную на зайца. Отсюда первая версия: предок мог быть охотником-псарем, державшим таких собак, или просто страстным зайчатником. Но у слова есть и второе, менее очевидное значение — гриб, известный как чешуйчатый трутовик или пестрец. Он растёт на стволах лиственных деревьев, съедобен, а в народной медицине его применяли как лекарственное средство. Если прозвище пошло от гриба, родоначальник мог быть грибником, сборщиком или знахарем, использовавшим этот трутовик. Какая из версий вернее — сказать трудно, обе бытовали в крестьянской среде, где и охота, и сбор дикоросов были делом привычным.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Заячник прибавили суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Заячника). Окончание -а — родовой признак женской формы. По сословному происхождению Заячниковы — скорее всего, крестьяне или однодворцы, так как фамилии от прозвищ, а не от крестильных имён, чаще встречались в непривилегированных слоях. В документах фамилия встречается нечасто, но географически привязана к центральным и южнорусским областям, где была распространена и охота с гончими, и сбор трутовиков. В целом, фамилия редкая и сохранила в себе сразу два бытовых образа — псовой охоты и лесного промысла.