Фамилия Зайденбаум — яркий пример ашкеназской фамилии, образованной по немецкой модели. Она составная: первая часть, «зайден» (seiden), переводится с немецкого и идиша как «шёлковый», а вторая, «баум» (Baum), означает «дерево». В буквальном смысле — «шёлковое дерево». Однако за этим прямым переводом стоит не ботаника, а торговля или ремесло.

Скорее всего, фамилию дали предку, который торговал шёлком или работал с шёлковыми тканями. В немецкоязычной еврейской среде такие «профессиональные» фамилии были распространены: их часто присваивали при обязательной паспортизации еврейского населения в Австрийской империи (конец XVIII — начало XIX века) и в германских землях. Чиновник мог записать человека по названию его товара, а не по точному ремеслу. «Шёлковое дерево» — метафоричный образ, который мог закрепиться за купцом, чей товар ассоциировался с роскошью и дороговизной.

Менее вероятная, но возможная версия — топонимическая. В Германии и Австрии есть несколько небольших мест с названием Зайденбаум (например, в Баварии). В этом случае фамилия указывала бы на выходца из такого поселения, но массовость фамилии среди евреев Восточной Европы говорит скорее в пользу «профессионального» происхождения.

Суффикс в фамилии отсутствует: это чистая немецкая основа без славянских окончаний. Именно поэтому носители фамилии Зайденбаум в России, Польше и Украине сохранили её в неизменном виде, без добавления -ов или -ин. Фамилия не склоняется по падежам в русском языке, что типично для заимствованных немецких композитов.

По сословной принадлежности предки Зайденбаумов в Российской империи относились к мещанам или купцам. Среди носителей фамилии встречались и раввины, и врачи, и промышленники, но единого социального портрета нет — фамилия была распространена по всей черте оседлости, от Прибалтики до Бессарабии.