Традиционно «достойные» мусульманские имена призваны наделить ребенка различными благами и расположить к нему высшие силы. Фамилия Зайнакаева образована от имени Зайнакай. Оно, скорее всего, является вариантом имени Зайнак, которое представляет собой производную форму именования Зайнулла. Имя Зайнулла состоит из двух частей: «зайни» и «улла». Первая из них берет начало от арабской основы «зайни» со значение «с украшениями, с узорами». Вторая часть имени Зайнулла переводится с арабского языка как Аллах. Таким образом именование Зайнулла можно трактовать как «украшение Аллаха». Таким образом, потомок человека, которого звали Зайнакай, со временем получил фамилию Зайнакаева. Представители фамилии Зайнакаевых внесены в различные исторические источники. Так, в документах Республики Башкирия упоминаются Адыльгарей Саитович Зайнакаев, родившийся в 1921 году, Айгиш Зайнакаевич Зайнакаев, родившийся в 1901 году, Касим Зайнакаевич Зайнакаев родившийся в 1903 году.