Фамилия Зайнахова образована от мужского имени Зайнах, которое в свою очередь является диалектной или разговорной формой арабского имени Зайнулла (Зайнулла). В переводе с арабского «Зайнулла» означает «украшение Аллаха» или «краса Аллаха». Имя было широко распространено в среде татар, башкир и других тюрко-мусульманских народов Поволжья и Урала. Суффикс -ов(а) указывает на русскую модель образования фамилий, которая закрепилась у многих нерусских народов в XIX–XX веках. По сути, фамилия Зайнахова — это «дочь (или жена) Зайнаха», то есть потомок человека с таким именем.

Интересно, что в тюркских языках имя могло приобретать и бытовые сокращения — Зайнак, Зайнаха. В некоторых говорах татарского языка звук «х» на конце мог заменять более мягкие окончания, поэтому Зайнах — это вариант, близкий к народной речи. Фамилия встречается преимущественно у татар, а также у башкир, особенно в Татарстане, Башкортостане и в диаспорах этих народов за пределами республик. География бытования довольно узкая: основное ядро носителей сосредоточено в регионах традиционного проживания тюрко-мусульманских народов.

С точки зрения словообразования, фамилия Зайнахова стоит в ряду однокоренных: Зайнуллин, Зайнаков, Зайнутдинов. Но Зайнахова выделяется тем, что в основе лежит именно уменьшительно-ласкательная или просторечная форма имени, а не полное имя или имя с патронимическим суффиксом. Это может говорить о том, что предок носителя был известен в своей среде не по официальному имени, а по домашнему прозвищу, что нередко встречалось в сельской среде.