Фамилия Зайнчковський — один из тех редких случаев, когда внешне славянская форма скрывает корень, уводящий в другую языковую среду. На первый взгляд, суффикс -овськ-/-евськ- типичен для польских и украинских фамилий, образованных от географических названий: он указывает на связь с местом, откуда человек родом. Так, Зайнчковський мог означать «тот, кто из Зайчкова» или «Зайнчкова». Но загвоздка в основе.

Корень «зайнч-» не имеет прямого аналога в восточнославянских языках. Самое вероятное объяснение — это адаптация немецкой или еврейской фамилии. В немецком «Zain» или «Zayn» — старое слово, означающее «прут», «жезл» или «металлический стержень», а также встречающееся как компонент фамилий ремесленников (например, Zainhammerschmied — кузнец, работающий с прутковым железом). Суффикс -чик-/-чк- (в данном случае «-чк-») в польско-украинской среде часто добавляли к иноязычным основам, чтобы придать им привычное звучание. Таким образом, Зайнчковський могло возникнуть как «обрусевшая» или «ополяченная» форма немецкой фамилии Zainke или Zainczyk.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с диалектным польским словом «zając» (заяц). Однако тогда форма была бы «Заёнчковский» (Zajączkowski), что широко известно. Отклонение в «Зайнч-» скорее говорит о том, что носитель фамилии или его предки произносили основу на немецкий манер, а писцы фиксировали её на слух.

Географически фамилия встречается почти исключительно на территории современной Украины и в исторической Малопольше. Это подтверждает версию о переселенцах — возможно, немецких колонистах, которых в XVII–XVIII веках приглашали в Галицию и на Волынь. Их фамилии со временем адаптировались под местные модели, и «Зайнчковський» — один из следов этого процесса. В отличие от массовых славянских фамилий на -ский, эта несёт отпечаток конкретного ремесленного или топонимического корня, который без специального разбора не прочитать.