Фамилия Зеграчёв — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В русской ономастике нет устоявшейся версии, поэтому разбираться приходится по словообразовательной модели и возможным корням.

Первое, что бросается в глаза, — суффикс -ев. Он указывает на типичную русскую патронимическую (от отчества) или прозвищную фамилию. Основа — Зеграч. Вопрос в том, что это за слово.

Самый вероятный путь — связь с диалектным или иноязычным прозвищем. В русских говорах слово «зегра» или «зегрица» не зафиксировано в широком обиходе, но в псковских и новгородских диалектах встречается «зег» — так называли кукушку (от звукоподражания «ку-ку»). Маловероятно, что прозвище «Зеграч» образовано напрямую от «кукушки», но фонетически возможно. Гораздо логичнее предположить, что в основе лежит западнославянское или балтийское влияние. В польском языке есть слово zegar — «часы», а также zegarmistrz — «часовщик». В белорусских и украинских говорах «зегар» или «зегжик» — то же самое. Прозвище Зеграч могло означать «часовщик» или «тот, кто чинит/делает часы». Переход «г» в «ч» при образовании прозвища (Зегар → Зеграч) — явление нередкое для восточнославянской народной этимологии.

Вторая, менее вероятная версия — от имени Зигфрид или его краткой формы Зиг. В русской среде такое имя могло трансформироваться в «Зегра», а затем в «Зеграч». Но для этого нужно допустить, что фамилия возникла в среде, где были немцы или скандинавы, что для массового крестьянского именования маловероятно.

Географически фамилия Зеграчёв почти не встречается в центральной России. Единичные носители зафиксированы в западных областях (Смоленская, Брянская, Псковская), что косвенно подтверждает связь с западнославянским или балтийским корнем. В этих краях исторически было сильное влияние польской и литовской культур, а ремесло часовщика было распространено среди городских мещан.

Таким образом, Зеграчёв — скорее всего, потомок человека, которого прозвали Зеграч за его профессию (часовщик) или за какую-то характерную черту, связанную с часами (пунктуальность, любовь к порядку, возможно, звонкий голос). Фамилия осталась в узком локальном ареале и не стала массовой.