В основе фамилии Зепалин, вероятно, лежит прозвище Запал. Оно может восходить к глаголу "запаливать", что значит "начинать жечь или стрелять" или "швырнуть, кинуть, ударить кого-то". Можно предположить, что такое прозвище могли дать вспыльчивому человеку, драчуну или поджигателю. Нельзя исключать, что Запалом предка Зепалиных прозвали от нарицательного "запал". Так называли затравку у пушки и проводку, горючую нитку, проводимую к заряду, при подрывании камней. Поэтому, прозвище Запал могли дать солдату, который служил при пушке и тому, кто работал, например, в каменоломне. Соответственно, в фамилии может содержаться указание на род деятельности предка Зепалиных. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Запал, со временем получил фамилию Зепалин.