Фамилия Зезен — редкий случай в русском ономастиконе. Её происхождение неочевидно, и носителю такой фамилии стоит рассматривать как минимум две версии, одна из которых ведёт в немецкие земли, а другая — в южнорусские говоры.

Первая и наиболее вероятная гипотеза — немецкая. Фамилия Зезен (Sesen) могла попасть в Россию вместе с переселенцами-немцами, которых приглашали в XVIII–XIX веках осваивать Поволжье, Новороссию и Причерноморье. В немецком языке это топонимическая фамилия: существует город Зезен (Seesen) в Нижней Саксонии, а также несколько небольших поселений с похожим названием. Переселенцы часто брали фамилию по месту выхода, и Зезен могла закрепиться за выходцем оттуда. В пользу этой версии говорит и то, что фамилия не имеет характерных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский), а оканчивается на согласный — типичная модель для немецких фамилий, которые русифицировались без изменения окончания.

Вторая версия — южнорусская или украинская. В диалектах встречается слово «зезень» или «зезя» — так могли называть человека с заметным дефектом речи, картавого или шепелявого. В украинском языке есть глагол «зезнути» (исчезнуть, пропасть), но он вряд ли стал основой для фамилии. Если фамилия действительно славянская, то она могла образоваться от прозвища Зезен, которое дали человеку с невнятной речью. Однако эта версия слабее, потому что прозвища с корнем «зез-» в русских говорах редки и не дали массовых фамилий.

С точки зрения географии, фамилия Зезен встречается точечно — в основном на юге России и в бывших немецких колониях. В советских архивах и базах данных погибших в Великой Отечественной войне есть носители фамилии, приписанные к Волгоградской, Ростовской областям и Краснодарскому краю — как раз к регионам, где компактно жили поволжские немцы.

Сравнение с однокоренными фамилиями ничего не даёт: ни Зезенов, ни Зезенских в русском ономастиконе практически нет. Это дополнительно указывает на то, что фамилия не вписалась в стандартную русскую модель образования через суффиксы, а сохранила исходную форму — что типично для иноязычных фамилий.

Таким образом, если ваши предки жили в Поволжье или Причерноморье, скорее всего, корни фамилии немецкие, и она связана с названием города или местности. Если же фамилия встречается в центральных или южных русских областях вне зон немецкой колонизации, стоит присмотреться к диалектному прозвищу — хотя этот случай гораздо реже.