Фамилия Жафярова образована от мужского имени Жафяр — скорее всего, диалектального варианта арабского имени Джафар (Жафар). Это имя имеет два основных толкования. Первое — «руководитель, начальник»: давая такое имя сыну, родители желали ему стать лидером, добиться славы и уважения. Второе значение — «райский ручей»; здесь имя несут пожелание вырасти достойным мусульманином, что естественно для общества, где религия играла ключевую роль.

Сама фамилия Жафярова — женская форма, а мужской вариант — Жафяров. Она построена по стандартной для тюркских и кавказских фамилий модели: основа (имя Жафяр) плюс русский суффикс принадлежности -ов (в женском роде -ова). Такие фамилии закрепились в основном в XIX—XX веках, когда у народов, исповедующих ислам, начали массово оформлять родовые имена по русскому образцу.

Географически фамилия Жафярова встречается в регионах с татарским и башкирским населением, а также среди народов Кавказа, где распространено имя Джафар. В написании через «ё» — Жафёрова — она редка; вариант с «я» (Жафярова) считается нормативным.

Сравните с однокоренными фамилиями: Джафаров (азербайджанский, дагестанский вариант), Жафаров (татарский, башкирский). В русском контексте фамилии на -ов от имени Джафар писались по-разному, пока не устоялось написание через «я» как отражение мягкого произношения.

Окончательно установить, когда и где именно возник род Жафяровых, можно только по генеалогическим данным — архивным записям, метрическим книгам, ревизским сказкам. Но уже понятно, что основа фамилии — мужское имя с богатой символикой: от лидерства до религиозной чистоты.