Фамилия Жаферова — женская форма фамилии Жаферов, и её происхождение напрямую связано с мужским личным именем, лежащим в основе. Если отбросить типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Жаферов сын, Жаферова дочь), остаётся корень Жафер. Это имя, скорее всего, восходит к арабскому Джафар (جعفر), что означает «ручей», «источник» или, по другой версии, «молоко» в значении «чистый, свежий». В исламской традиции это имя одного из сподвижников пророка Мухаммеда и четвёртого шиитского имама Джафара ас-Садика, поэтому оно широко распространено у народов, исповедующих ислам.

Фонетическая перестройка «Джафар» в «Жафер» — характерная черта тюркских языков, где начальный звонкий «дж» часто смягчается или переходит в «ж». Поэтому носители фамилии Жаферов/Жаферова — это, как правило, потомки тюркоязычных народов (татары, башкиры, азербайджанцы, кумыки, ногайцы) или народов Кавказа, у которых имя бытовало в такой огласовке. Фамилия могла закрепиться в России в XIX–XX веках, когда крестьянам и горожанам массово присваивали фамилии по имени отца.

Интересно, что суффикс -ов в этой фамилии указывает на обрусение: носители, попав в русскоязычную среду, адаптировали окончание по самой распространённой модели. В исконной тюркской среде фамилия могла бы звучать как Жафер оглы (сын Жафера) или просто Жафер. Таким образом, Жаферова — это не просто «дочь Жафера», а маркер того, что предок жил в регионе, где русская административная система требовала фамилии с русским окончанием, но сохранил память о своём имени в тюркском произношении.