Фамилия Жаныкеева — женская форма фамилии Жаныкеев, и её происхождение ведёт не в славянскую, а в тюркскую языковую среду. Основа фамилии — мужское личное имя Жанык, которое в свою очередь образовано от слова «жан» (душа, близкий человек, любимый) с уменьшительно-ласкательным суффиксом -ык. Таким образом, Жанык — это «душенька», «милый», «родной». Такие имена-пожелания были распространены у многих тюркских народов: имя должно было принести ребёнку счастье и любовь окружающих.

Модель образования фамилии — типичная для русского языка, но адаптированная к нерусской основе. Русский патронимический суффикс -ев (в женском роде -ева) присоединили к тюркскому имени Жанык. Это указывает на то, что предок носителя фамилии жил в зоне активных русско-тюркских контактов — скорее всего, на территории Казахстана, Кыргызстана, Башкортостана или Татарстана, где фамилии на -ев/-ов нередко давали оседлым или принявшим православие тюркам.

Интересная деталь: написание фамилии через «е» после «к» (Жаныкеев, а не Жаныков) указывает на то, что в основе имя Жанык, а не Жаныкбай или Жаныкбек. Если бы в основе было имя с конечным твёрдым согласным, суффикс был бы -ов. Здесь же мягкий вариант -ев говорит о том, что исходное имя оканчивалось на мягкий или шипящий звук — что и даёт Жанык.

Социальный контекст: фамилия не дворянская и не купеческая. Скорее всего, её получили потомки простых кочевников или крестьян, закрепившихся на одном месте в XIX — начале XX века, когда массово фиксировались фамилии для податного населения. Встречается фамилия в основном в Кыргызстане и Казахстане, реже — среди татар и башкир.

Других версий, например, связи с каким-то ремеслом или топонимом, нет — корень «жан» слишком прозрачно указывает на личное имя. Это редкий случай, когда этимология почти однозначна и не требует гаданий.