Фамилия Жауна — одна из тех, чья этимология упирается в географию, а не в русскую морфологию. В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский. Это указывает на то, что перед нами не исконно русская фамилия, а заимствованная, скорее всего, из латышского или литовского языка. В латышском языке слово «žauna» означает «челюсть» или «скула». Прозвище по такой внешней примете — крупная или выступающая челюсть — могло закрепиться за человеком и перейти в фамилию.

Другая, менее вероятная версия связывает фамилию с эстонским словом «jaun» — «молодой». В таком случае Жауна могла быть адаптацией эстонской фамилии, например, Jaun или Jauns. Но латышский корень выглядит убедительнее, поскольку в Латвии фамилия Жауна (Žauna) встречается чаще, и её значение прозрачно для носителей языка.

На территории бывшей Российской империи фамилия могла появиться через миграцию прибалтийских крестьян или мещан, особенно в XIX веке, когда в Курляндской и Лифляндской губерниях активно давали фамилии по прозвищам. Важно и то, что в русском языке окончание -а не менялось, так как слово воспринималось как цельное, без склонения по мужскому роду (как, например, фамилия Дурново или Шевченко). Поэтому носитель фамилии Жауна мог быть и мужчиной, и женщиной — грамматически фамилия не указывает на пол.

В отличие от многих русских фамилий, которые образовывались от имени отца, Жауна — это прямое прозвище, без патронимического суффикса. Предок мог получить его за характерную черту лица или, в редких случаях, за молодость (если верна эстонская версия). Географически фамилия сосредоточена в Латвии и среди латышской диаспоры, а в России встречается редко, что делает её своеобразным маркером прибалтийского происхождения.