Фамилия Жерганов образована от прозвища Жерган, которое, скорее всего, восходит к древнетюркскому слову «жерге». В монгольском, киргизском, казахском языках оно означает «ряд, строй; степень, очередь». Вполне вероятно, что родоначальник Жергановых занимал высокое положение в обществе — слово «жерге» могло указывать на человека, стоящего в определённом чине или занимающего важную ступень в социальной иерархии. В пользу этой версии говорит и модель фамилии: суффикс -ов типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, и закрепился в XVI–XVII веках, когда тюркские заимствования активно входили в обиход.

Однако есть и другая, более приземлённая версия. В тюркских языках существует слово «жер» — «земля», а «жерген» могло означать «оседлый», «живущий на земле» или даже «земледелец». Тогда прозвище Жерган могло принадлежать крестьянину, а не знатному лицу. Обе гипотезы имеют право на существование, но первая выглядит правдоподобнее из-за конкретного значения «степень, чин» в древних источниках.

В Книге памяти Республики Мордовия упоминается повар Жерганов Алексей Алексеевич, родившийся в 1912 году в деревне Чумартово. Эта запись — редкий документальный след фамилии, который показывает, что к началу XX века Жергановы жили в Поволжье, в зоне активных контактов с тюркскими народами. Сама фамилия встречается нечасто, и её носители сосредоточены в основном в Мордовии и соседних регионах, что подтверждает её локальное происхождение.