Фамилия Жибченко звучит на слух необычно, и это не случайно. В её основе лежит прозвище, а не церковное имя, что сразу указывает на народное, бытовое происхождение. Самое правдоподобное объяснение — связь с украинским или южнорусским словом «жиба», которое означает «жаба». Прозвище Жиба могли дать человеку с большим ртом, навыкате глазами или просто за неприятный, квакающий голос. Менее вероятна, но возможна связь с глаголом «жибить» (гнуть, жать) — в этом случае прозвище могло относиться к сутулому или прижимистому человеку.

Модель образования фамилии типична для украинской и белорусской традиции. Суффикс «-енко» (уменьшительно-патронимический) означает «маленький» или «потомок»: Жибченко — буквально «сын Жибка» или «маленький Жиба». Такие фамилии массово закреплялись в казацкой среде Левобережной Украины и юга России в XVII–XVIII веках. Географически фамилия чаще всего встречается в Сумской, Полтавской и Черниговской областях, что подтверждает её украинские корни.

Интересная деталь: в отличие от более распространённых фамилий на «-енко» (Шевченко, Коваленко), у Жибченко необычная основа. «Жиба» — слово неласкательное, почти бранное. Такие прозвища давали не в обиду, а как оберег или для контраста: считалось, что если назвать ребёнка «жабой», он вырастет здоровым и красивым. Так что предок-носитель фамилии, скорее всего, был простым казаком или крестьянином, а не дворянином — в реестрах шляхты фамилии с такой основой не встречаются.

В написании фамилии встречаются варианты: Жибченко, Жибченко, реже — Жебченко. Последний вариант мог возникнуть под влиянием акающих говоров, где «и» и «е» путались. Важно не путать её с фамилией Жабченко (от «жаба» в прямом значении) — у Жибченко корень именно через «и», что указывает на диалектные особенности произношения в конкретной местности.