Фамилия Жидунов образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Жидунов образована от прозвища Жидун, которое восходит к прилагательному "жидкиий". Однако не исключено, что данное прозвище связано со словом «жид» — обычно так называли скупого, корыстного человека. Менее правдоподобной представляется версия, согласно которой, прозвище Жидун восходит к нарицательному «жид» в значении «еврей». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Жидун, со временем получил фамилию Жидунов. О точном месте и времени возникновения фамилии Жидунов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Жидунов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.