Фамилия Жилгельдина — женская форма фамилии Жилгельдин. Её основа почти наверняка тюркская, и разумнее всего искать корни в казахском или башкирском языках. Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Жилгельдин, то есть потомок человека по прозвищу Жилгельды.

Разбираем имя-основу. «Жил» или «жил» в тюркских языках (например, в казахском жыл) означает «год». «Гельды» (или «келды») — очень распространённый компонент личных имён, означающий «пришёл», «явился». Вместе «Жылгельды» можно перевести как «год пришёл» или «явился в год». Такие имена часто давали в традиционных обществах: либо ребёнку, родившемуся в трудный или знаменательный год, либо как пожелание, чтобы следующий год принёс удачу. Это не фамилия в современном смысле, а личное прозвище или имя, которое затем закрепилось за родом.

С точки зрения словообразования, фамилия Жилгельдина стоит в ряду таких же русских по форме, но тюркских по корню фамилий, как Надырова, Бекмурзина, Уразбаева. Суффикс -ин здесь работает так же, как в фамилиях Пушкин или Гагарин, только основа не славянская.

Географически фамилия Жилгельдина встречается прежде всего в Оренбургской области, в Башкортостане и в северных районах Казахстана. Это зона активного взаимодействия русских и тюркских народов, где в XIX веке при переписях и паспортизации тюркские имена и прозвища записывали на русский лад. Сословно носители фамилии, скорее всего, были из крестьян или казаков, а не из дворян: длинные составные тюркские имена в высшее сословие попадали редко.

Спорных версий у этой фамилии немного. Вариант, что основа — это искажённое немецкое или еврейское имя, маловероятен: приставка «жил-» в славянских языках (от «жилой», «жильё») дала бы фамилию с другим суффиксом, например Жильцов или Жилин. Поэтому тюркское происхождение — единственное правдоподобное объяснение.