Фамилия Жилкайдаров образована от имени Жилкайдар. Первая его часть, предположительно, восходит к казахскому слову «жыл» - «год». Вторая часть имени – Кайдар – представляет собой казахский вариант имени Гайдар (Хайдар), которое в переводе с арабского означает «лев». Нарекая ребенка таким именем, родители желали, чтобы их сын рос здоровым, сильным, крепким мальчиком. Кроме того, имя Жилкайдар мог получить ребенок, родившийся в год Льва по восточному календарю. Так, в Книге памяти Алма-Атинской области записаны казахи Жилкайдаров Нисимбай, который родился в 1878 году (Алма-Атинская обл., Каратальский р-н), и Жилкайдаров Сагит-Сары, рожденный в 1894 году.