Фамилия Жижемская — женская форма фамилии Жижемский, и её происхождение почти наверняка связано с географическим названием. В отличие от большинства русских фамилий на -ов/-ев, которые образованы от имени или прозвища отца, фамилии на -ский/-цкий в старину чаще всего указывали на владение землёй или происхождение из определённой местности. Такой тип был особенно распространён среди дворянства и шляхты.

Корень «Жижем-» отсылает к нескольким возможным топонимам. Самый вероятный — река Жижма или Жижемка, протекающая в бассейне Немана, на территории современной Беларуси и Литвы. В этих краях известен и населённый пункт Жижма (Жижмори). Фамилия Жижемский могла принадлежать роду, владевшему землями по берегам этой реки. Вторая версия — ойконим Жижма в бывшем Виленском воеводстве. В польской и литовской ономастике фамилии с таким окончанием и корнем встречаются именно как указание на родовое гнездо.

Модель образования проста: основа «Жижем-» (название реки или села) плюс типичный для знатных родов суффикс -ск-, окончание -ий/-ая. Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Жи́жемская, хотя в разговорной речи возможны варианты. Интересно, что фамилия не получила широкого распространения — она остаётся редкой, что подтверждает её узколокальное, шляхетское происхождение: такие фамилии редко переходили к крестьянам, приписанным к чужой земле.

Спорных версий немного. Иногда корень пытаются связать с древнерусским «жижа» (жидкая грязь, топь) — мол, прозвище человека, жившего у болота. Но это маловероятно: для прозвищного происхождения типичнее суффикс -ин или -ов, а не -ский. Географическая привязка здесь надёжнее и объясняет и редкость, и форму фамилии.