Фамилия Жолдымуратов происходит от мужского тюркского имени Жолдымурат. В её основе лежит казахское слово «жолды», которое переводится как «правильный, уместный, успешный, везучий, удачливый». Вторая часть имени — «мурат» — арабского происхождения и означает «цель, желание, намерение». Таким образом, имя Жолдымурат можно истолковать как «счастливая цель» или «удачливое желание».

С точки зрения словообразования фамилия построена по классической для русской ономастики модели: к основе прибавляется суффикс -ов, который изначально указывал на принадлежность («сын Жолдымурата»). Со временем потомки человека с таким именем закрепили за собой фамилию Жолдымуратовы.

Фамилия имеет чёткую региональную привязку — она распространена преимущественно в казахской среде. Встречаются и варианты написания, например, Жолдамуратов, где первая часть имени передаётся через «а». Это связано с особенностями произношения в разных диалектах казахского языка: звук «о» в безударной позиции мог редуцироваться до «а».

Интересно, что корень «жол» в тюркских языках многозначен: помимо «пути» и «дороги», он может означать «счастливый случай» или «удачу». В казахском языке есть родственные фамилии с тем же корнем — Жолдасов, Жолдыбаев, где вторая часть имени указывает на другие качества (например, «бай» — богатый). Но в случае с Жолдымуратовым акцент сделан именно на везении и успешности, что делает эту фамилию «говорящей» о благопожелании, которое родители вкладывали в имя предка.