Фамилия Жожин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа, «жожа», в современном русском языке отсутствует, что заставляет искать корни либо в диалектах, либо в иноязычных заимствованиях.

Самая вероятная версия связывает фамилию с прозвищем или профессией. В северных и сибирских говорах «жожа» — это народное название посконной или крапивной лихорадки, а также вообще любой сыпи или кожного раздражения. Прозвище Жожа могли дать человеку с рябым лицом или с нервной привычкой ёжиться, вздрагивать. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын Жожи. Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ с окончанием на -а/-я (ср. Гаврилин, Ерёмин).

Есть и альтернативная, менее распространённая гипотеза. Слово «жожа» могло быть искажением тюркского «жож» или «джодж» — так в некоторых тюркских языках называют крупного жука или червя. Если предок занимался кожевенным делом или жил в местности, где водился такой жук-кожеед, прозвище могло прикрепиться к нему. Однако эта версия слабее: тюркское влияние на фамилию с русским суффиксом -ин менее типично для центральных регионов России.

Морфологически фамилия проста: корень жож- и окончание -ин. Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Жо́жин. Встречается фамилия в основном в Вологодской, Архангельской и Кировской областях — то есть в зоне бытования северорусских говоров, где слово «жожа» было в ходу. В дореволюционных переписях носители Жожины числились преимущественно среди государственных крестьян.

Таким образом, если вы носите фамилию Жожин, ваш предок, вероятно, жил на Русском Севере и получил прозвище по внешней особенности или по профессии, связанной с обработкой кожи. Фамилия не дворянская и не купеческая — её корни в крестьянском быту.