Фамилия Жугор — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет типичных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу выдаёт нерусскую или искусственную модель образования. Скорее всего, перед нами фамилия, закрепившаяся в виде прозвища без дополнительного оформления — так называемая «чистая» основа.

Проще всего объяснить Жугор через южнославянские языки. В сербском, хорватском и болгарском слово «жугор» (или «жугор») означает «угорь» — рыбу отряда угреобразных. Прозвище могли дать человеку за внешнее сходство (гибкий, скользкий, увёртливый) или за то, что он ловил и продавал угрей. Такие «рыбные» прозвища встречаются у балканских славян, а оттуда могли попасть в русскую среду через переселенцев или служилых людей.

Вторая версия связывает фамилию с диалектным глаголом «жугорить» — в некоторых говорах так говорят о ворчливом, брюзгливом человеке, который постоянно «жужжит». Тогда Жугор — это прозвище ворчуна. Но эта гипотеза слабее, потому что глагол редкий и не имеет устойчивой письменной фиксации.

Если смотреть на географию, то фамилия Жугор встречается в основном на западе Украины и в приграничных с Беларусью районах. Это наводит на мысль о польском или белорусском следе: в польском языке есть слово «żugor» (устар., диалектное) — то же, что «угорь». Фамилия могла оформиться ещё в Речи Посполитой, а затем перейти в русскую среду при присоединении земель.

Таким образом, наиболее вероятное значение фамилии Жугор — «угорь», прозвище рыбака или человека с ужимками этой рыбы. Фамилия недворянская, скорее крестьянская или мещанская, и явно не массовая: число носителей по России не превышает нескольких сотен человек.