Фамилия Жуникова — женская форма фамилии Жуников. В русской традиции фамилии на -ов/-ев, -ин принадлежали в основном дворянству, купечеству и духовенству, но со временем распространились во всех сословиях. В данном случае суффикс -ов указывает на происхождение от мужского имени или прозвища: Жуник.

В основе фамилии лежит прозвище Жук. В русских говорах «жук» — не только насекомое, но и человек с тёмными глазами или волосами, а также плутоватый, хитрый. Уменьшительная форма Жуник могла означать «маленький жук» или «сын Жука». Такие прозвища давали по внешности (чернявый, смуглый) или по характеру (ловкий, изворотливый). В ономастике это типичная модель: от прозвища на -ик (Жуник) через притяжательное прилагательное (Жуников) к фамилии.

Спорных версий здесь немного. Иногда Жуник выводят из диалектного «жунить» — «жужжать, надоедать», но это маловероятно: глагол редок, а прозвище от насекомого встречается повсеместно. Более правдоподобна связь с тюркскими корнями, где «жук» могло быть искажением личного имени (например, Жунус), но для фамилии Жуникова такое предположение остаётся гипотезой без серьёзных доказательств.

Фамилия нечастая, но встречается в нескольких регионах: в центральной России, на Урале и в Сибири. В XIX веке Жуниковы фиксировались среди крестьян и мещан — вероятно, предки занимались земледелием или ремёслами. Сословная принадлежность не была однородной: встречаются и однодворцы, и казаки, что говорит о широком бытовании прозвища.

Особенность фамилии — в её прозрачной этимологии. В отличие от многих фамилий с затемнённым смыслом, Жуникова почти наверняка связана с миром насекомых, и это даёт читателю простую и яркую картинку: предок мог быть чернявым, юрким или просто носил прозвище, данное в шутку.