Фамилия Женикова — женская форма, парная к мужской Жеников. Её основа неочевидна на первый взгляд, и здесь есть простор для версий. Самый прямой путь — от имени или прозвища Женя, которое в русской традиции могло быть как сокращением от Евгений (благородный), так и самостоятельным просторечным именем. Суффикс -ов- указывает на типичную модель русской фамилии: чей? — Жеников, то есть потомок человека по имени или прозвищу Женя. Но есть и другая, более редкая возможность.

В северных и сибирских говорах слово «женить» имело не только прямое значение, но и переносное — «хлопотать, усердно добиваться». Отсюда могло возникнуть прозвище Женик — человек настойчивый, сваха или хлопотун. В этом случае фамилия оказывается связана не с именем, а с характером или родом занятий предка. Подтверждением служат однокоренные фамилии Женихов, Женихин, которые тоже встречаются в русском ономастиконе, но Жеников стоит особняком — суффикс -ик здесь редуцировался до -ик- в основе, что характерно для прозвищных форм.

Географически фамилия Женикова встречается в центральных и северных областях России, но не образует крупных гнёзд. Это редкая фамилия, что говорит о её локальном происхождении — возможно, от одного-двух родоначальников. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) она не упоминается в основных списках, но это не редкость для фамилий, образованных от уменьшительных имён без дополнительных суффиксов. Таким образом, наиболее вероятно, что Жениковы — потомки человека, которого в быту звали Женя, и фамилия закрепилась за его детьми в той форме, которая была естественна для местного говора.