Фамилия Зилипуткин — одна из тех редких русских фамилий, которая ставит в тупик даже опытного ономаста. На первый взгляд она звучит как что-то инородное или сказочное, но на деле имеет вполне конкретную и прозаичную природу. Разбирать её стоит с конца, с суффикса.

Суффикс -ин указывает на притяжательную модель: «чей?» — Зилипуткин, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Зилипутка. Это классическая русская модель образования фамилий, распространённая в северных и центральных областях России. Форма на -ин, а не на -ов, подсказывает, что основа, скорее всего, заканчивалась на -а или согласный (как в фамилиях Пушкин, Репин, Бородин).

Главная загадка — корень Зилипут-. Здесь возможны две версии, и обе указывают на прозвище.

Первая и самая правдоподобная версия — диалектная. В русских говорах Вологодчины, Архангельской области и Урала встречается слово «зилипутка» или «зилипуток». Так в XIX веке называли человека маленького роста, коротышку, «недомерка». Слово это, в свою очередь, происходит от искажённого французского «Lilliput» — страны лилипутов из романа Джонатана Свифта. Книга пользовалась популярностью, и грамотные крестьяне или мелкие чиновники могли дать такое прозвище низкорослому соседу или родственнику. Со временем оно закрепилось как фамилия.

Вторая версия — топонимическая. Прозвище Зилипутка могло быть связано с названием населённого пункта. В Вятской губернии (современная Кировская область) исторически существовала деревня Зилипутки (или Зилипутово). Такие названия могли давать по первому поселенцу — тому самому Зилипутке. Однако здесь мы сталкиваемся с логическим кругом: деревню назвали по прозвищу человека, а не наоборот.

Что в итоге? Скорее всего, предок носителя этой фамилии был невысоким человеком, за что и получил прозвище, ставшее впоследствии фамильным именем. Сословно фамилия не дворянская — суффикс -ин в сочетании с такой прозрачной основой характерен для крестьянской и мещанской среды. Географически фамилия тяготеет к Северо-Востоку европейской России (Вологда, Вятка, Пермь). Это редкая фамилия, и найти её в дореволюционных метрических книгах — большая удача для генеалога.