Фамилия Зиненберг — немецкая по происхождению, и это сразу определяет угол разбора. Она сложена из двух частей: «Зинен» и «берг». Вторая часть, -берг, в немецких фамилиях встречается постоянно и означает «гора». Первая часть может восходить к личному имени Зино (Zieno) — краткой форме от Зигфрид или другого имени на Зиг- (победа), либо к слову «Siene» — «сито». Тогда Зиненберг — это либо «гора Зино», то есть владение или место человека с таким именем, либо «гора, где делают сита», что указывает на ремесло.

Такие фамилии на -берг обычно давали не крестьянам, а людям, жившим у заметной возвышенности, или тем, кто владел землёй на ней. В немецкой ономастике модель «имя + берг» — типичный способ обозначить хутор или усадьбу. Если основа — ремесло, то предок мог быть ситником, мастером по плетению сит. Второй вариант встречается реже, но исключать его не стоит.

Написание фамилии — Зиненберг, а не, скажем, Зинненберг — указывает на восточно-немецкие или силезские корни. В тех регионах часто упрощали двойные согласные, а суффикс -ен- в середине характерен для фамилий, образованных от названий поселений. То есть Зиненберг могло быть и топонимом: деревня или гора, названная по первому владельцу.

В России фамилия редкая. Носители — потомки немецких переселенцев, которых приглашали в XVIII–XIX веках. Скорее всего, это колонисты из Поволжья или Причерноморья, либо немцы, служившие в русской армии. Сословно — мещане или крестьяне, реже дворяне, если семья дала офицеров. Точных генеалогических данных по известным носителям в открытых источниках нет, так что глубже копать надо в архивах лютеранских приходов или метрических книгах немецких колоний.