Фамилия Зиннатшина — женская форма мужской фамилии Зиннатшин, которая образована по самой распространённой в русской ономастике модели: к основе добавляется суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Если Зиннатша — глава семьи, то его домочадцы, а затем и потомки, получали прозвание Зиннатшины. В русском языке такие фамилии на -ин типичны для слов, оканчивающихся на -а или -я.

Корень здесь — тюркское личное имя Зиннатша. Это сложносоставное имя, где первая часть «зиннат» восходит к арабскому слову со значением «украшение», «драгоценность», «роскошь». Вторая часть — «ша» — это сокращённая форма от персидского «шах» (господин, царь, владыка). Таким образом, имя Зиннатша в буквальном смысле означает «украшение шаха» или «драгоценный, как у владыки». Встречается и более поэтичное толкование: «тот, кто украшает собой власть» или «царское украшение».

Мужская форма Зиннатшин — это типичный отчество-патроним: «чей сын?» — «Зиннатшин», то есть сын Зиннатши. Фамилия крепко привязана к регионам традиционного проживания татар и башкир, где такие имена были распространены. Встречается она в Татарстане, Башкортостане, а также среди татарской диаспоры в других областях России, например, в Оренбургской и Челябинской. Социальный контекст её появления — крестьянская или мещанская среда, где фамилии закрепились относительно поздно, в XIX — начале XX века, часто при переписях или после отмены крепостного права.

Интересно, что в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые в русском языке доминируют, форма на -ин для тюркских имён не редкость, но она подчёркивает именно ассимиляцию имени в русскую грамматику. В татарской среде фамилия могла бы звучать иначе — например, Зиннатшин у башкир и татар нередко пишется без изменений, но женская форма Зиннатшина в русском контексте становится обязательной. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Зинна́тшина, хотя в бытовой речи возможны варианты.