Фамилия Зинатшина — это женская форма, а её мужской вариант — Зинатшин. Обе формы образованы по стандартной для русского языка модели: к основе добавляется суффикс принадлежности -ин, который отвечает на вопрос «чей?» и указывает на родство. В данном случае — «дочь (или жена) Зинатши».

Разбор начинается с корня. Основа «Зинатш» — это не русское слово, а искажённое в бытовой речи татарское или башкирское мужское имя. Исходное имя — Зинатулла (Zinätulla), что в переводе с арабского означает «украшение Аллаха» или «краса Аллаха» (от «зинат» — украшение, и «Аллах» — Бог). В тюркской среде, особенно в Поволжье, имя Зинатулла было распространено, но в просторечии часто сокращалось до Зинатша или Зинатш: отпадала конечная часть «-улла», а на конце появлялся характерный для татарского языка аффикс -ша, образующий ласкательные или уменьшительные формы имён.

Таким образом, фамилия Зинатшин (и Зинатшина) — это типичный пример патронимической фамилии, которая закрепилась у татар, башкир и других народов, исповедующих ислам, в период массовой русификации имён в XIX–XX веках. Предок носителя фамилии, скорее всего, был известен в своей общине под именем Зинатша (или Зинатулла), и его дети получили фамилию по отцу.

Географически фамилия почти наверняка восходит к регионам с компактным проживанием татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская, Ульяновская области. Встречается она нечасто, что говорит о её локальном происхождении — возможно, от конкретного рода или селения.

Словообразовательный нюанс: в отличие от русских фамилий на -ин, где основа часто оканчивается на -а или -я (Петя — Петин), в фамилии Зинатшин основа заканчивается на шипящий -ш. Это нехарактерно для исконно русских имён, но нормально для тюркских заимствований. Фамилия не имеет отношения к каким-либо ремёслам или прозвищам — она чисто именная, религиозная по корню, и её значение напрямую связано с мусульманской традицией именования.