Фамилия Зизисов — редкий пример греческого происхождения в русском ономастиконе. Она образована от греческого имени Зисис (Ζήσης), которое, в свою очередь, восходит к древнегреческому глаголу ζέω (zéo) — «кипеть, бурлить» или к слову ζωή (zoí) — «жизнь». Таким образом, имя Зисис можно перевести как «живой», «кипучий», «полный сил». В греческой традиции это имя часто давали в честь святого Зисиса, почитаемого в православии. Русский суффикс -ов присоединился к основе при адаптации фамилии в славянской среде, превратив греческое имя в типичную русскую фамилию со значением «потомок Зисиса».

Основа фамилии — Зизис — представляет собой вариант греческого имени Зисис. В русском языке звук [з] мог удвоиться под влиянием произношения или при записи фамилии в документах. В греческом языке имя Зисис имеет варианты Зис, Зисис, а также уменьшительные формы. Фамилия Зизисов — это не греческая фамилия как таковая, а русская фамилия, возникшая у потомков грека по имени Зисис, переселившегося в Россию, вероятно, в XVIII–XIX веках. Греческие общины в тот период активно селились в южных регионах Российской империи — на Кубани, в Крыму, в Одессе, в Мариуполе. Именно там фамилия Зизисов и могла закрепиться.

Модель образования — патроним с суффиксом -ов — указывает на то, что носитель фамилии — потомок человека, которого звали Зизис. В русской традиции такие фамилии обычно закреплялись за крестьянами, мещанами или казаками, но в случае с греческими переселенцами — часто за торговцами, ремесленниками или моряками. Сословная принадлежность конкретных носителей фамилии Зизисов не зафиксирована в массовых источниках, но можно предполагать, что предки были выходцами из греческой диаспоры, которые сохраняли свою культуру и веру.

Фамилия остаётся редкой. Её носители в основном сосредоточены на юге России и в странах бывшего СССР, куда мигрировали греки в советское время. Встречаются также варианты написания: Зисисов, Зизис. Разбор фамилии показывает, что за ней стоит не просто прозвище, а целая история переселения и адаптации греческого имени в русской языковой среде.