Фамилия Зизора — редкая и неочевидная. Её звучание и написание не укладываются в привычные модели русских фамилий, что сразу указывает на нерусское происхождение. Искать корни стоит в польском, украинском или белорусском языках, где подобные формы встречаются чаще.

В основе фамилии, скорее всего, лежит прозвище Зизор. В диалектах польского языка слово «zizor» или «zyzor» могло означать «задира», «ершистый человек» или «тот, кто косится» (от «zez» — косоглазие). Это прозвище давали либо человеку с особенностью зрения, либо вспыльчивому и неуживчивому соседу. Фамилии на -а в славянской традиции характерны для украинской и белорусской ономастики: в этих языках ударное окончание -а часто закреплялось за прозвищами без дополнительных суффиксов (сравните: Голова, Скоробога, Непийвода). Так что Зизора — это, вероятно, украинизированная или белоруссизированная форма исходного польского прозвища.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с литовским словом «zyzoti» (глазеть, таращиться). В пограничных районах Беларуси и Литвы такие заимствования не редкость, и фамилия могла возникнуть на стыке языков. В этом случае прозвище Зизора означало бы «зевака» или «любопытный».

Официально фамилия Зизора не относится к дворянским, и её носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами западных губерний Российской империи. Географически фамилия рассеяна, но чаще встречается в современной Украине (особенно в центральных и западных областях) и в восточной Польше. Встретить Зизору в центральной России — большая редкость, что только подтверждает её западнославянские или балтийские корни.