Фамилия Злокотин — редкая, бросающаяся в глаза, и её значение лежит почти на поверхности. Первая часть, «зло-», в русских прозвищах и фамилиях часто указывала не на злобный характер человека, а на его бедовую долю или необычное, «лихое» свойство. Вторая часть, «-котин», восходит к слову «коть» или «кот». В старых русских говорах «коть» — это не только домашнее животное, но и прозвище для нелюдимого, вороватого или, наоборот, ласкового и льстивого человека. Однако в сочетании с «зло-» смысл меняется.

Самая вероятная версия: Злокотин — это человек, который «злой как кот», то есть угрюмый, недоброжелательный, скрытный. В крестьянской среде такое прозвище могли дать за неуживчивый нрав или за то, что человек «по-кошачьи» делал пакости. Менее очевидный, но возможный вариант: прозвище относилось к тому, кто мучил или обижал котов, — этакого «злого кошатника» наоборот. В любом случае, основа ясна и прозрачна.

По модели образования фамилия типична для центральной и северной России: суффикс -ин указывает на принадлежность: «Злокотин» — сын или потомок Злокота. Фамилия не дворянская и не купеческая, а крестьянская или мещанская, скорее всего, закрепившаяся в одной из северных или вологодских губерний, где сохранялись архаичные прозвища с корнем «кот». Встретить её можно редко, и это делает её ценной для тех, кто ищет свои корни: прозвище было ярким, а значит, почти наверняка запомнилось и попало в переписные книги XVII–XVIII веков.