Фамилия Злыткина образована от имени или прозвища Злытка. В народе имя Злытка давали ребенку с противоположным значением — как оберег. Считалось, что если назвать мальчика «злым» именем, злые силы к нему не пристанут, а вырастет он добрым и ласковым. Это типичная древнерусская практика охранительных имен, когда родители нарекали ребенка Некрасом, Дураком или Злыткой, надеясь на обратный результат.

Менее вероятно, что прозвище Злытка закрепилось за неприветливым или раздражительным взрослым человеком. Такие прозвища давали по характеру, но они реже становились основой для фамилий, чем охранительные имена.

Есть и третья версия, более редкая. В украинском языке слово «злиток» означает «слиток» — кусок расплавленного металла, отлитый в форму. Если принять эту версию, прозвище Злытка мог получить человек, связанный с металлургией или ювелирным делом. Тогда основатель рода Злыткиных был не злым, а мастеровым — литейщиком или плавильщиком.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Злыткин — сын Злытки. Такая модель типична для фамилий, образованных от имен и прозвищ на -а, -я. При склонении женский вариант фамилии — Злыткина.

Фамилия встречается в центральных и южнорусских областях, а также на Украине, что подтверждает обе возможные основы: как древнерусскую охранительную традицию, так и украинское ремесленное прозвище.